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人类基因图谱的完成得力资讯科技的帮助

作者:黄俊义时间:2000-06-28来源:CTIMES收藏

Celera Genomics、Sanger Centre和Whitehead Institute以及美国健康协会(National Institute of Health)日前宣布,已经完成人类排序,并强调这项历史性的科学成就,得力於的卓越运算技术。这项历史性的研究所使用的超级电脑,就是执行Tru64 UNIX以及TruCluster软体的Compaq

本文引用地址:http://www.eepw.com.cn/article/184397.htm

Celera执行长J. Craig Venter在美国表示:「这是人类有史以来,首度以线状形式排列人体。」Celera将32亿对依照正确顺序排列,完成了迄今最大的运算挑战。

在排序过程中,Celera采用了超过600个康柏Alpha伺服器,每秒可执行将近一兆个作业程序,由於演算作业与资料储存需要64 gigabytes的分散式记忆体,所以最後的排序运算采用康柏全新AlphaServer GS160。

位於英国的Sanger Centre,乃由Wellcome Trust与英国医学研究评议会(British Medical Research Council)共同成立,在研究过程中需要能够承担绘制基因图谱与编排人类基因序列挑战的运算架构。於是,Sanger资讯技术主管Phil Butcher提出了三项选择原则:延展性、适应性以及发展弹性。

Sanger最初的架构包括160台康柏Alpha工作站、4套康柏AlphaServer 1200系统,和一个可执行BLAST (基本的本地排序搜寻工具)的小型个人电脑丛集,支援网际网路基因资料库的搜寻存取。

该中心不断地补强运算基层架构,最後总共采用了将近250部执行Tru64 UNIX的康柏AlphaServer与工作站、1部拥有4个TeraByte磁碟空间的StorageWorks Raid系统、1部300 GB Network Appliances Raid子系统,以及48台康柏Deskpro个人电脑。

本文由 CTIMES 同意转载,原文链接: http://www.ctimes.com.tw/DispCols/cn//%E5%BA%B7%E6%9F%8F%E8%AE%A1%E7%AE%97%E6%9C%BA/%E9%9D%9EPC%E4%B8%BB%E6%9C%BA/%E4%B8%80%E8%88%AC%E6%80%A7%E4%BC%BA%E6%9C%8D%E4%B8%BB%E6%9C%BA/0006281640ZB.shtml



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